Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpn3Q9D3W4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms