Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D3J9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D3J9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms