Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms