Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms