Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pbdc1Q9D0B6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms