Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cmtm8Q9CZR4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm8Q9CZR4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms