Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NubplQ9CWD8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms