Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrxn1Q9CS84 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrxn1Q9CS84 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms