Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl28Q9CR40 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms