Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ifitm3Q9CQW9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms