Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQM1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQM1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQM1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQM1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms