Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccer1Q9CQL2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccer1Q9CQL2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms