Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp2Q9CQ73 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms