Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms