Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Use1Q9CQ56 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Use1Q9CQ56 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Use1Q9CQ56 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Use1Q9CQ56 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Use1Q9CQ56 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Use1Q9CQ56 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Use1Q9CQ56 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Use1Q9CQ56 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms