Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ncbp2Q9CQ49 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms