Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrrc18Q9CQ07 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms