Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ska1Q9CPV1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ska1Q9CPV1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms