Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cox6cQ9CPQ1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cox6cQ9CPQ1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms