Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prpf8Q99PV0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prpf8Q99PV0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms