Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim12aQ99PQ1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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