Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Scd3Q99PL7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scd3Q99PL7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scd3Q99PL7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scd3Q99PL7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scd3Q99PL7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scd3Q99PL7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scd3Q99PL7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scd3Q99PL7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scd3Q99PL7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms