Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtn4rQ99PI8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms