Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp16Q99LG0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms