Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Clint1Q99KN9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Clint1Q99KN9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Clint1Q99KN9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Clint1Q99KN9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Clint1Q99KN9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clint1Q99KN9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clint1Q99KN9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clint1Q99KN9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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