Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lims1Q99JW4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms