Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GatbQ99JT1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GatbQ99JT1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms