Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms