Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxp3Q99JB6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxp3Q99JB6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms