Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtn4ip1Q924D0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rtn4ip1Q924D0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rtn4ip1Q924D0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms