Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtpbp3Q923K4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Gtpbp3Q923K4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gtpbp3Q923K4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms