Protein–RNA interactions for Protein: Q922R0

Prkx, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit PRKX, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkxQ922R0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkxQ922R0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkxQ922R0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms