Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atl3Q91YH5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms