Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SelenomQ8VHC3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms