Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms