Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc92Q8VDN4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc92Q8VDN4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms