Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap2Q8R574 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prpsap2Q8R574 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms