Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Vmn1r200Q8R281 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Vmn1r200Q8R281 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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Vmn1r200Q8R281 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Vmn1r200Q8R281 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Vmn1r200Q8R281 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Vmn1r200Q8R281 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Vmn1r200Q8R281 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Vmn1r200Q8R281 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Vmn1r200Q8R281 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r200Q8R281 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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