Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms