Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrtm1Q8K377 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrtm1Q8K377 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms