Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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