Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33aQ8K0Y2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt33aQ8K0Y2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms