Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc47a1Q8K0H1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc47a1Q8K0H1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms