Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne5Q8JZW4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms