Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc4a8Q8JZR6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms