Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf17Q8CFA7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms