Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc28aQ8CEI3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms