Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufl1Q8CCJ3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufl1Q8CCJ3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms