Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dclre1bQ8C7W7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms