Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7E7

Stbd1, Starch-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stbd1Q8C7E7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stbd1Q8C7E7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stbd1Q8C7E7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stbd1Q8C7E7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stbd1Q8C7E7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stbd1Q8C7E7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms